Ce site archéologique constitue les restes d'une ville fondée vers le VIIIe siècle av. J.-C. à la fin de l'époque minoenne et qui connut son apogée à l'époque hellénistique.
Aptera, par sa position stratégique au-dessus de la baie de Souda, possédait deux ports et continua à être une importante cité au cours de la période romaine puis au début de l'Empire byzantin.
Elle fut détruite par deux tremblements de terre, aux IVe et VIIe siècles, puis par les Sarrasins en 823. Par la suite, les Vénitiens construisirent un fort à l'emplacement de la cité, mais il fut détruit par des pirates en 1583.
Sa position stratégique a également été exploitée par les Ottomans, qui firent construire à peu de distance la forteresse de Koules, qui domine encore de nos jours toute la baie de Souda.
De premières fouilles ont été menées par l’Ecole française d’archéologie en 1862 et 1864 et le site étalé dans des oliveraies fait toujours actuellement l'objet de fouilles systématiques et de travaux de conservation. Le site est assez étendu et mélange différentes époques: citernes romaines, théâtre hellénistique achevé par les Romains, monastère byzantin, etc.
Comme le site est bien moins connu que Knossos et Phaistos, il n'est pas victime du surtourisme et c'est un vrai plaisir de le visiter, d'autant plus qu'il est assez bien ombragé. Pas de buvette sur place cependant, donc prévoyez de l'eau si vous souhaitez tout voir en prenant votre temps!
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